Convocatoria a estudiantes para trabajo de grado y/o posgrado
No Vigente
Instituciones convocantes
- Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable
Descripción
El proyecto se centra en el parásito Trypanosoma cruzi, protozoario causante de la enfermedad de Chagas. Su ciclo de vida transcurre entre dos hospederos, un insecto vector y varias especies de mamíferos. Los cambios de ambiente que enfrenta el organismo conllevan procesos drásticos de diferenciación celular, distinguiéndose al menos cuatro formas, tres de las cuales interaccionan directamente con las células del mamífero. Nuestro conocimiento actual de los perfiles de expresión genética del parásito en los diferentes estadios, así como durante su diferenciación, se basa en el análisis de transcriptómicos a nivel de poblaciones.
Recientemente la metodología de transcriptómica de célula única (scRNA-seq) ha abierto la posibilidad de estudiar a nivel de expresión génica la heterogeneidad presente en las poblaciones celulares. Esto ha significado un importante incremento en el poder de resolución para describir la expresión genética de los organismos, resultando en la caracterización de nuevos aspectos biológicos relevantes en diversos organismos. El proyecto busca conocer la heterogeneidad presente en poblaciones de T. cruzi, haciendo uso de esta técnica novedosa, enfocando el análisis al perfil de expresión de antígenos de superficie (dada su relevancia en la interacción huésped-patógeno).
Los candidatos se formarán en trabajo experimental, mediante el uso de metodologías básicas de biología molecular, cultivo celular (parásitos y líneas de células eucariotas), citometría de flujo, así como un especial énfasis en análisis globales de expresión génica mediante el uso de técnica de secuenciación masiva, tanto “bulk” RNA-seq como RNA-seq de célula única.
El proyecto se realizará en colaboración con investigadores nacionales, así como de Argentina y Reino Unido, abriendo la posibilidad de realizar pasantías en estos países.
Enviar CV y carta de motivación al correo electrónico psmircich@fcien.edu.uy:
Dr. Pablo Smircich
Profesor Adjunto
Laboratorio de Interacciones Moleculares, Facultad de Ciencias
Laboratorio de Bioinformática del Departamento de Genómica, IIBCE
Período
Fecha comienzo: 15/09/2021
Fecha final: 24/09/2021