Llamado a estudiante para realizar tesis de posgrado en el Laboratorio de Interacción Planta-Microorganismo

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Llamado a estudiante de posgrado para realizar su tesis en el en el Laboratorio de Interacción Planta-Microorganismo, del Departamento de Bioquímica y Genómica Microbianas, IIBCE. Se llama a un estudiante de posgrado para realizar su tesis en el marco del proyecto “Búsqueda de los mecanismos involucrados en la promoción del crecimiento de plantas de caña de azúcar por la cepa Kosakonia radicincitans UYSO10”, financiado por el Fondo Clemente Estable FCE_3_2020_1_162195.

Instituciones convocantes

  • Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable

Descripción

Resumen del proyecto: Las bacterias promotoras del crecimiento vegetal (PCV) son una estrategia viable ambiental y económica para mejorar la sustentabilidad de la explotación de cultivos de importancia agronómica. Particularmente los endófitos bacterianos son aquellos que habitan los tejidos internos de las plantas, para los cuales está ampliamente demostrada su capacidad PCV. Sin embargo, poco se conoce de los mecanismos de acción y las bases moleculares imperantes en la interacción endófito-planta.

El proyecto tiene como objetivo la búsqueda e identificación de posibles mecanismos PCV en la cepa endófita y diazótrofa Kosakonia radicincitans UYSO10 y la determinación de su posible rol en la interacción con plantas de caña de azúcar. Para esto se realizarán dos aproximaciones complementarias: i- identificar genes bacterianos expresados diferencialmente en distintas etapas de la interacción planta-bacteria mediante una aproximación transcriptómica, y ii- determinar el rol de posibles características PCV identificadas en la interacción planta-bacteria, mediante la construcción y caracterización in vitro e in vivo, de mutantes puntuales.

 

Propuesta de tesis: La tesis se centrará en la identificación de genes bacterianos expresados diferencialmente en las distintas etapas de la interacción planta-bacteria mediante la aplicación de la técnica RNAseq. Para esto se plantea evaluar la expresión génica de la cepa creciendo en presencia de exudados radiculares de plantas de caña de azúcar, en co-cultivo con la planta y en presencia del líquido apoplástico. Para los análisis bioinformáticos se cuenta con la colaboración del grupo de la Dra. Alexandra Stoll (Ceaza, Chile). Posteriormente los resultados obtenidos se validarán mediante la técnica de q-RT-PCR.

Perfil: Licenciados en Ciencias Biológicas, Bioquímica o Química, con interés de cursar un posgrado (excluyente).

Condiciones: Se cuenta con un contrato de investigación en el marco del proyecto para los primeros 7 meses. Se espera que el estudiante se postule a los llamados de becas de la ANII. El contrato inicia en agosto del 2021.

Lugar de trabajo:  Laboratorio de Interacción Planta-Microorganismo del Departamento de Bioquímica y Genómica Microbianas, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable.

Orientadores: Dra. Cecilia Taulé y Dr. Federico Battistoni.

Enviar CV, escolaridad y carta de motivación resaltando la adecuación al perfil y disponibilidad horaria a ctaule@iibce.edu.uy, fbattistoni@iibce.edu.uy. Aquellos estudiantes pre-seleccionados serán entrevistados.

 

        Kosakonia radicincitans UYSO10 colonizando la superficie de raíces de plantas de caña de azúcar Kosakonia radicincitans UYSO10 colonizando los espacios intercelulares de tallos de plantas de caña de azúcar  Vista de un ensayo de respuesta de plantas de caña de azúcar a la inoculación con bacterias promotoras del crecimiento vegetal

Período

Fecha comienzo: 23/07/2021

Fecha fin: 30/08/2021

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