Nuevo método simplifica el estudio de la síntesis de proteínas a escala genómica
La investigación, publicada en la revista científica NAR Genomics and Bioinformatics, propone el uso de la enzima benzonasa para generar «huellas ribosomales», pequeños fragmentos que permiten analizar qué ARN mensajeros están siendo traducidos activamente dentro de las células.
Según el estudio, esta estrategia simplifica el procedimiento experimental, reduce tiempos y costos, y disminuye posibles sesgos asociados a protocolos tradicionales basados en la enzima RNAse I.
El trabajo fue realizado por Guillermo Eastman y José Sotelo, del Departamento de Genómica del IIBCE y la Sección Biología Celular de la Facultad de Ciencias de la Udelar. La investigación se desarrolló en colaboración entre el IIBCE, la Facultad de Ciencias y la University of Virginia, Estados Unidos.
Además de comparar el desempeño de benzonasa y RNAse I en la obtención de huellas ribosomales, el estudio logró adaptar la técnica para su aplicación en muestras biológicas complejas y de baja cantidad celular, como cultivos neuronales embrionarios de ratón. Esto amplía las posibilidades de uso de Ribo-seq en modelos biológicos donde hasta ahora su implementación resultaba más desafiante.
Ribo-seq es una herramienta clave para estudiar la regulación de la expresión génica a nivel de traducción, es decir, el proceso mediante el cual la información contenida en el ARN se convierte en proteínas. Comprender estos mecanismos resulta fundamental para investigar procesos biológicos y enfermedades neurodegenerativas, entre otras áreas de estudio.
El artículo, titulado «The use of Benzonase to produce ribosome footprints simplifies translational levels quantification by Ribo-seq», está disponible en https://academic.oup.com/nargab/article/8/2/lqag049/8678687
Galería de imágenes
Análisis de tamaño y cantidad de huellas ribosomales, perfil de tres muestras y sus diferentes picos Descargar imagen : Análisis de tamaño y cantidad de huellas ribosomales, perfil de tres muestras y sus diferentes picos
Gel de poliacrilamida usado para separar fragmentos de ARN por tamaño y analizar huellas ribosomales Descargar imagen : Gel de poliacrilamida usado para separar fragmentos de ARN por tamaño y analizar huellas ribosomales
