Líneas de investigación del Departamento de Biología Molecular
Líneas de investigación
Bases moleculares de la respuesta de defensa vegetal frente a microorganismos patógenos
Responsable: Dra. Inés Ponce de León
El objetivo de nuestro trabajo es comprender los mecanismos de defensa que activan las plantas en respuesta a microorganismos patógenos que causan enfermedades con el fin de mejorar la resistencia. Para ello nos enfocamos en la identificación y análisis funcional de genes, proteínas y metabolitos involucrados en la resistencia vegetal frente al estrés biótico. Además, estudiamos cómo estos mecanismos de defensa han evolucionado utilizando plantas basales como el musgo Physcomitrella patens.
Actualmente utilizamos plantas de interés agronómico y plantas modelo. Dentro de los patosistemas en estudio se encuentran: 1) papa y patógenos fúngicos, 2) soja y Diaporthe phaseolorum causante del cancro del tallo, y 3) las plantas modelo Arabidopsis thaliana y Physcomitrella patens y su interacción con una variedad de fitopatógenos incluyendo Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, Botrytis cinerea, Pythium, Colletotrichum gloeosporioides y Alternaria sp.
Gametogénesis e infertilidad
Responsable: Dra. Rosana Rodríguez Casuriaga
En humanos la infertilidad afecta al 10 a 15% de las parejas en edad reproductiva. En los últimos 50 años se ha registrado un continuo aumento de casos de infertilidad, por lo que su estudio es imprescindible. Un 60% de los casos tienen causas genéticas. En ~25% de los casos la causa se desconoce, clasificándose como infertilidad idiopática. El estudio exhaustivo en humanos es imposible debido a la usual escasez de material, impedimentos éticos y diagnóstico usualmente muy posterior al momento de la falla.
En el marco de esta línea de investigación, hemos generado líneas murinas modelo de infertilidad que nos han permitido aportar al conocimiento de las bases moleculares —causas y mecanismos— de patologías reproductivas encontradas en humanos, así como al conocimiento de la gametogénesis en condiciones de salud. Los modelos generados se vienen empleando en diferentes proyectos financiados para contestar diversas preguntas biológicas, resultando de interés tanto para el conocimiento básico como aplicado, dada su potencial utilidad biomédica. Algunas de las preguntas básicas se están abordando en colaboración con el Departamento de Genética del IIBCE.
Los encares metodológicos involucrados incluyen: edición genética mediante CRISPR/Cas9 (colaboración con UBAL, IPMon); análisis y purificación celular mediante citometría de flujo (trabajo conjunto con la Plataforma de Citometría de Flujo y Clasificación Celular del IIBCE); análisis bajo diversos tipos de microscopía (Plataforma de Microscopía del IIBCE); análisis transcriptómicos comparativos en condiciones de salud y enfermedad/infertilidad (colaboración con Departamento de Genómica del IIBCE); silenciamientos génicos transitorios y permanentes, entre otros.
Estudios genéticos en vías del metabolismo secundario de Cannabis
Responsable: Dra. Astrid Agorio
Las plantas de Cannabis poseen un metabolismo secundario extremadamente rico. La utilización de variedades de esta especie para uso terapéutico, recreacional o industrial depende del contenido y proporción de algunos de sus metabolitos secundarios, especialmente los cannabinoides. En nuestro laboratorio estudiamos la variabilidad y regulación genética del metabolismo secundario en Cannabis con el fin de aportar información y comprender porque una variedad de Cannabis produce unos metabolitos frente a otros. Actualmente estamos especialmente enfocados en estudiar la síntesis del ácido delta-9-tetrahydrocannabinolico (THCA) y del ácido cannabigerólico (CBDA), dos metabolitos únicos de esta especie y de gran interés para el uso medicinal del Cannabis.