Líneas de Investigación del Departamento de Biología Molecular
Líneas de investigación:
Bases moleculares de la respuesta de defensa vegetal frente a microorganismos patógenos.
Responsable: Dra. Inés Ponce de León
El objetivo de nuestro trabajo es comprender los mecanismos de defensa que activan las plantas en respuesta a microorganismos patógenos que causan enfermedades con el fin de mejorar la resistencia. Para ello nos enfocamos en la identificación y análisis funcional de genes, proteínas y metabolitos involucrados en la resistencia vegetal frente al estrés biótico. Además, estudiamos cómo estos mecanismos de defensa han evolucionado utilizando plantas basales como el musgo Physcomitrella patens.
Actualmente utilizamos plantas de interés agronómico y plantas modelo. Dentro de los patosistemas en estudio se encuentran: 1) papa y patógenos fúngicos, 2) soja y Diaporthe phaseolorum causante del cancro del tallo, y 3) las plantas modelo Arabidopsis thaliana y Physcomitrella patens y su interacción con una variedad de fitopatógenos incluyendo Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, Botrytis cinerea, Pythium, Colletotrichum gloeosporioides y Alternaria sp.
Expresión génica durante el desarrollo de la línea germinal masculina.
Responsable: Dra. Adriana Geisinger
Los objetivos son: 1) aportar a la comprensión de las bases moleculares de la reproducción masculina, y 2) identificar genes expresados diferencialmente en cada etapa, y posibles genes blanco de tratamientos terapéuticos así como contraceptivos masculinos. En el marco de esta línea hemos caracterizado los transcriptomas codificante y no codificante (ARNs no codificantes largos) de cuatro etapas clave de la espermatogénesis del ratón mediante secuenciación masiva. Estamos también realizando estudios de procesamiento alternativo y caracterizando mecanismos de regulación postranscripcional en este sistema.
Nuestra línea involucra citometría de flujo, secuenciación masiva, análisis bioinformáticos, microscopía de alta resolución, y producción de ratones knock-out para genes de interés mediante la metodología CRISPR/Cas9, entre otras.
Generación de líneas de ratones modelo para el estudio de la etiología y mecanismos de infertilidad humana idopática.
Responsable: Dra. Rosana Rodríguez Casuriaga
En humanos la infertilidad afecta al 10-15% de parejas en edad reproductiva. En los últimos 50 años se ha registrado un continuo aumento de casos de infertilidad, por lo cual su estudio es imprescindible. Un 60% de los casos tienen causas genéticas. En ~25% de los casos la causa se desconoce (infertilidad idiopática). El estudio exhaustivo en humanos es imposible por escasez del material, impedimentos éticos y diagnóstico usualmente muy posterior al momento de la falla.
En el marco de un primer proyecto en esta línea, se han generado ratones modelo conteniendo mutaciones equivalentes a las observadas en humanos para el gen codificante de un componente proteico de elemento central de complejo sinaptonémico. Esto está permitiendo caracterizar el fenotipo mutante, estudiar causas y mecanismos de este tipo de infertilidad.
Estudios genéticos en vías del metabolismo secundario de Cannabis.
Responsable: Dra. Astrid Agorio
Las plantas de Cannabis poseen un metabolismo secundario extremadamente rico. La utilización de variedades de esta especie para uso terapéutico, recreacional o industrial depende del contenido y proporción de algunos de sus metabolitos secundarios, especialmente los cannabinoides. En nuestro laboratorio estudiamos la variabilidad y regulación genética del metabolismo secundario en Cannabis con el fin de aportar información y comprender porque una variedad de Cannabis produce unos metabolitos frente a otros. Actualmente estamos especialmente enfocados en estudiar la síntesis del ácido delta-9-tetrahydrocannabinolico (THCA) y del ácido cannabigerólico (CBDA), dos metabolitos únicos de esta especie y de gran interés para el uso medicinal del Cannabis.