Ministerio de Educación y Cultura

Tesis de grado

Jake Sheppard. 2024. Lic. en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, Udelar. Título: Análisis bioinformático de pequeños ARNs derivados de vtARNs humanos. Orientador: Rafael Fort. 

Martín Rivara. 2021. Lic. en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, Udelar. Título: Búsqueda in silico de posibles blancos drogables en kinetoplástidos. Orientador: Pablo Smircich.

Lucas Inchausti. 2020. Lic. en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, Udelar. Título: Relación entre en el uso de codones y niveles de tRNAs y su influencia en la eficiencia traduccional de proteínas en T. cruzi. Orientador: Pablo Smircich.

Victoria Coello. 2019. Tecnicatura en Biotecnología, UTEC y PCTPC. Título: Caracterización por microscopía de fuerza atómica (AFM) de regiones promotoras de ARNPI en tripanosomátidos. Orientador: Pablo Smircich.

Joaquín Garat. 2018. Lic. en Bioquímica, Facultad de Ciencias, Udelar. Título: Análisis de localización diferencial de ARN mensajeros codificante para proteínas ribosomales en neuronas. Orientadora: Mag. Joaquina Farías. Coorientador: José R. Sotelo Silveira.

Lucía Bilbao. 2018. Lic. en Bioquímica, Facultad de Ciencias, Udelar. Título: Puesta a punto y establecimiento de cultivo in vitro de amastigotas axénicos de Trypanosoma cruzi como posible modelo de estudio de amastigotas celulares. Coorientador: Pablo Smircich.

Tesis de maestría

Laura Vera. (en curso). Maestría en Bioinformática, Pedeciba. Título: Detección de variantes de secuencia en un genoma humano mediante el estudio y ensayo de diferentes metodologías de análisis computacional. Coorientador: José R. Sotelo Silveira.

Mateo Francois. (en curso). Maestría en Biología, Pedeciba. Título: Identificación y caracterización de secuencias de ácidos nucleicos participantes en el alineamiento y recombinación durante la meiosis. Coorientador: José R. Sotelo Silveira. Becario ANII.

Santiago Licandro. (en curso). Posgrado en Biotecnología, Facultad de Ciencias, Udelar. Título: Secuenciación masiva de amplicones para el estudio de patógenos microbianos en superficies de Unidades de Cuidados Intensivos. Orientador: José R. Sotelo Silveira. Coorientador: Pablo Smircich. Becario ANII.

Matías Pereiro. 2025. Maestría en Biotecnología, Facultad de Ciencias; Udelar. Título: Integración de Secuenciación Masiva al Monitoreo de Plantas de tratamiento de Aguas Residuales Domésticas para el estudio de Comunidades Bacterianas y Genes de Patogenicidad. Coorientador: José R. Sotelo Silveira.

Martín Rivara. 2025. Maestría en Biología, Pedeciba. Título: Caracterización proteómica de la maquinaria traduccional de Trypanosoma cruzi. Orientador: José R. Sotelo Silveira. Coorientador: Pablo Smircich. Becario ANII.

Lucía Bilbao. 2024. Maestría en Biología, Pedeciba. Título: Estudios de transcriptómica comparativa en amastigotas axénicos versus amastigotas celulares de Trypanosoma cruzi. Orientador: Pablo Smircich. Coorientadora: Dra. Leticia Pérez (Facultad de Ciencias, Udelar). Becaria ANII.

Lucas Inchausti. 2023. Maestría en Bioinformática, Pedeciba. Título: Análisis funcionales de perfiles de co-expresión génica en Trypanosoma cruzi. Orientador: Pablo Smircich. Becario CAP.

Álvaro González. 2020. Maestría en Biotecnología, Facultad de Ciencias; Udelar. Título: Detección de microorganismos patógenos y generadores de toxinas en agua mediante secuenciación masiva. Orientador: José R. Sotelo Silveira.

Daniel Wolff. 2019. Maestría en Pro.In.Bio. Título: Prestar sin perder: La autoneurorrafia término-lateral en el tratamiento de las lesiones del sistema nervioso periférico. Coorientador: Dr. José R. Sotelo Silveira.

Santiago Radío. 2019. Maestría en Bioinformática, Pedeciba. Título: Mecanismos regulatorios de familias moduladas a nivel traduccional en Trypanosoma cruzi. Orientador: Pablo Smircich. Coorientador: Dr. Gustavo Gerberoff. Becario ANII y CAP finalización.

Martín Beracochea. 2018. Maestría en Bioinformática, Pedeciba. Título: Bioinformática aplicada al estudio genómico de las cepas endofitas Kosakonia sp. UYSO10 y Rhizobium sp. UYSO24. Coorientador: José R. Sotelo Silveira.

Pablo Peraza. 2017. Maestría en Biología, Pedeciba. Título: Estudio de la expresión génica en ovinos resistentes a parásitos gastrointestinales mediante RNA-Seq. Orientador: Gonzalo Rincón; Co-Orientador: Dr. José R. Sotelo Silveira y Gabriel Ciappesoni

Guillermo Eastman. 2016. Maestría en Biología, Pedeciba. Título: Análisis del efecto traduccional de PDCD4 en células neuronales mediante secuenciación masiva de huellas polisomales. Orientador: Dr. David Munroe (USA). Coorientador: José R. Sotelo Silveira. Becario ANII y CAP finalización.

Andrés Di Paolo. 2016. Maestría en Biología, Pedeciba. Título: Estudio sobre los mecanismos de regulación de la síntesis local de proteínas en axones periféricos. Orientador: Dr. José R. Sotelo Sosa (IIBCE); Coorientador: José R. Sotelo Silveira.

Irene da Cruz. 2015.  Maestría en Biología, Pedeciba. Título: Caracterización del brazo largo del cromosoma X de células CHO. Orientadora: María Vittoria Di Tomaso. Coorientadores: Gustavo Folle y José R. Sotelo Silveira

Tesis de doctorado

Paola Sosa Basso. (en curso) Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Anotación y caracterización funcional de lncRNAs en Trypanosoma cruzi. Orientador: Pablo Smircich. Becaria ANII.

Lucas Inchausti. (en curso) Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Rol de la proteína de unión al ARN TcUBP1 en la regulación traduccional de Trypanosoma cruzi. Orientador: Pablo Smircich. Becario ANII.

Pablo Peraza. (en curso). Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Diversidad microbiana ruminal: rol en las emisiones de metano y en la eficiencia de conversión de alimento en bovinos. Orientador: José R. Sotelo Silveira. Inicio: 2020. 

Joaquín Garat. (en curso). Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Análisis de expresión de genes codificantes para proteínas ribosomales en diferentes neuronas y compartimentos subcelulares. Orientador: José R. Sotelo Silveira. Coorientador: Pablo Smircich. Inicio: 2021. Becario ANII y CAP Finalización.

Juan Trinidad. 2025. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Anotación funcional de genes en kinetoplástidos mediante búsqueda de homología remota basada en estructura. Orientador: Pablo Smircich. Becario CAP. 

Carlos Romeo. 2025. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Patrones distintivos de expresión génica y procesamiento postranscripcional durante la espermatogénesis. Orientadora: Adriana Geisinger. Coorientador: José R. Sotelo Silveira. Becario CAP. 

Nicolás Papa. 2025. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Caracterización de la diapausa I en peces anuales del género Austrolebias: un abordaje morfológico y molecular. Coorientador: José R. Sotelo Silveira.

Santiago Chávez. 2023. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Expresión génica diferencial en la transición proliferativa G1-S de Trypanosoma cruzi. Orientadora: Dra. María Ana Duhagón (Facultad de Ciencias, Udelar). Coorientador: José R. Sotelo Silveira. 

Andrés Di Paolo. 2021. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Estudio de la Regulación, Localización e Identificación de proteínas neo-sintetizadas en el axón. Orientador: José Sotelo Sosa (IIBCE). Coorientador: José R. Sotelo Silveira y Dr. Federico Dajas-Bailador (Reino Unido). Becario ANII.

Guillermo Eastman. 2021.  Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Estudios sobre el control traduccional en modelos neuronales y su modulación por PDCD4. Orientador: José R. Sotelo Silveira. Coorientador: Dr. George Bloom (USA). Becario ANII.

Joaquina Farías. 2020.  Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Caracterización de los ARN mensajeros localizados en axones motores y sensoriales, y sus posibles cambios asociados al envejecimiento. Orientador: José R. Sotelo Silveira. Becaria ANII, Becaria CAP.

Rafael Fort. 2020. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Estudio de la función y de los genes blanco de un microARN desregulado en tumor de próstata. Orientadora: Dr. María Ana Duhagón (Facultad de Ciencias, Udelar). Coorientador: José R. Sotelo Silveira. Becario ANII y CAP finalización.

Fernanda Trovero. 2020. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Rol de los ARNs no codificantes largos en la espermatogénesis. Coorientador: José R. Sotelo Silveira.

Lucía Pastro. 2017. Doctorado en Biología, Pedeciba. Título: Estudio comparativo de transcriptoma nuclear y citoplasmático: implicancias en la regulación de la expresión génica en Trypanosoma cruzi. Orientadora: Dra. Beatriz Garat (Facultad de Ciencias, Udelar). Coorientador: José R. Sotelo Silveira.